Este programa de doutoramento teve nas suas primeiras edições apoio da Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT), através da atribuição de bolsas em ambiente empresarial, no âmbito de concursos específicos de bolsas de doutoramento em empresas (BDE).
Entre 2013 e 2018:
O programa usufruiu de bolsas de doutoramento suportadas pela FCT, englobadas no programa de doutoramentos FCT.
Em 2016:
Contou também com o financiamento de 5 bolsas de doutoramento apoiadas pelo programa de bolsas do Norte 2020.
Desde fevereiro de 2021:
O programa doutoral tem o suporte da FCT com o financiamento de 50 bolsas a distribuir por 5 edições, no âmbito do protocolo estabelecido em novembro de 2020 entre a FCT e a APQuímica, na área da Engenharia da Refinação, Petroquímica e Química.
Adicionalmente, os projetos de doutoramento do EngIQ poderão também ser suportados integralmente por empresas.