O EngIQ teve início em 2009/2010, por iniciativa de um conjunto de empresas industriais federadas na AIPQR (Associação das Indústrias da Petroquímica, Química e Refinação) que sentiram necessidade de criar instrumentos de formação avançada, com o objetivo de qualificar os seus recursos humanos e reforçar os seus sistemas de desenvolvimento e inovação.
O programa doutoral oferece condições de doutoramento em ambiente empresarial absolutamente únicas no país. Estas condições são asseguradas através de mecanismos simples, mas eficazes, de modo a que o projeto de doutoramento tenha profundidade científica e responda a desafios com relevância para as empresas.
O atual consórcio do EngIQ é formado pelas 5 principais universidades portuguesas, com ensino e investigação em Engenharia Química e Áreas Afins, bem como por um conjunto alargado de empresas, anteriormente associadas à AIPQR (até 2018), desde então associadas à APQuímica.